骨科論文自動化控制台

本地-only 主流程：Codex CLI / npm scripts / local files / openwiki。Notion、GPT Pro、live PubMed 目前保留為人工或可選。

可自動跑 / 有人工待辦 現在可以交給 launchd，等待週四 06:00 自動跑。

本地排程與 safety gates 已通過；人工項目不阻塞自動化，適合 10:00 閱讀後再處理。

下一次自動跑2026年8月20日星期四上午06:00 [GMT+8]；0 天 11 小時 0 分

Go / No-GoGO 12/12Executability

一致性33 ok / consistentConsistency

排程狀態loaded / synced / exit 0Diagnose

入口 smoke72/72 okHealth

本地連結992 ok / 0 errorLinks

Automation lockfreeLive

人工待辦4 項，10:00 後處理

資料新鮮度44/51 freshFreshness

Go / No-Go 一句話 看 12 個硬門檻

目前判斷GO：可以交給 launchd / 雙擊入口

硬門檻12/12 gates passed

未通過 recover無需修復

細節硬門檻全通過；可以等待週四 06:00，或手動雙擊 run-automation.command 驗收。

現在最該貼這段 Safe terminal

判斷現在建議：刷新視覺報表後再看 Go / No-Go

Go / No-GoNO-GO 9/12

原因launchd 本身看起來正常，但 executability 報表還沒證明全綠；先同步報表。

npm --prefix "." run sync:visuals -- "$(npm --prefix "." run -s status:path)"

入口 smoke breakdown 看 health 詳細檢查

START-HERE.command3/3 ok

run-automation.command3/3 ok

check-automation.command3/3 ok

open-control-center.command3/3 ok

do-recommended.command3/3 ok

sync-visuals.command3/3 ok

open-cockpit.command3/3 ok

open-live-monitor.command3/3 ok

open-decision.command3/3 ok

open-executability.command3/3 ok

open-safe-terminal.command3/3 ok

open-health.command3/3 ok

open-automation-manifest.command3/3 ok

open-daily-brief.command3/3 ok

open-current-run.command3/3 ok

open-receipt.command3/3 ok

open-debug-dashboard.command3/3 ok

open-latest-failure.command3/3 ok

open-gpt-handoff-bundle.command3/3 ok

install-launchd.command3/3 ok

install-and-test-launchd.command3/3 ok

repair-launchd.command3/3 ok

diagnose-launchd.command3/3 ok

kickstart-launchd.command3/3 ok

Operator Pick / 先看收據，再接人工 先打開最近一次自動化收據，確認產物可信。

本地自動化已 ready；先確認 local pipeline、verify、連結與產出檔都完成，再從人工待辦進 GPT Pro handoff。

open receipt START-HERE.command do recommended manual-actions 完整 next actions

現在最推薦雙擊 open-receipt.command

open "./START-HERE.command"

open "./do-recommended.command"

open "./open-receipt.command"

收據確認全綠後，打開 manual-actions.html 處理 GPT Pro handoff、OpenWiki review 與 RAG review。

最近一次成功 8/14 20:34 跑完，耗時 68.9 s。

完整 local pipeline 與 verify 報告已生成；可從 Run + verify report 查看每一步 log。

Run + Verify automation-log Timeline

Local steps38/38

Verify steps41/41

最慢步驟automation:local / 43.4 sSlowest detail

歷史成功率75% / 20 runs

receipt ok

最近一次自動化收據

最近一次本地流程與驗收流程都完成；這張收據用來判斷週四自動跑後是否真的留下可讀產物。

Run + Verify 完整收據 automation-log.json Timeline

開始時間8/14 20:34

總耗時68.9 s

Local steps38/38

Verify steps41/41

History2026-08-14T12-34-09-777Z

產出檔6/6

最高優先人工待辦 / high GPT Pro handoff：產生 clinical guide 並回填

GPT 導讀仍是需人工；RAG clinical review 也因此未完成。

manual-actions open bundle primary file support file

One-Stage Versus Two-Stage Exchange Arthroplasty for Periprosthetic Joint Infection

下一步開啟 gpt-pro-handoff.md。

接著將 mega.md 內容或檔案貼入 GPT Pro project thread。

一次開齊同時開啟 handoff 與支援文字檔。

open "./runs/2026-07-15/single-one-stage-versus-two-stage-exchange-arthroplasty-for-periprosthe/gpt-pro-handoff.md" open "./runs/2026-07-15/single-one-stage-versus-two-stage-exchange-arthroplasty-for-periprosthe/mega.md"

open "./runs/2026-07-15/single-one-stage-versus-two-stage-exchange-arthroplasty-for-periprosthe/gpt-pro-handoff.md"

open "./runs/2026-07-15/single-one-stage-versus-two-stage-exchange-arthroplasty-for-periprosthe/mega.md"

clinical-guide.md 已由 placeholder 替換成 GPT Pro 導讀，並已重跑 wiki:update / automation:check。

npm --prefix "." run wiki:update -- runs/2026-07-15/single-one-stage-versus-two-stage-exchange-arthroplasty-for-periprosthe/status.json

完整流程成功

Overviewready

Status可交給排程

State snapshotneeds attention

Timeline75% / 20 runs

Receiptready

Daily Brief3 papers / 2 manual

Decision可自動跑，人工項目不阻塞

Go / No-GoGO 12/12

Consistency33 ok / consistent

Preflight90 ok

Links992 ok

Automation lockfree

Verify81 ok

Run + Verify41 steps

Readiness可自動跑

Actions41/41

Next run0 天 11 小時 0 分

Next actions7 / 0 blockers

Entry points24/24

Operator pickopen-receipt.command

Status sourceautomation-run-and-verify.json

Safety gates守住 / 12

Capabilities14/15

Freshness44/51

Impact136/136

Goal coverage17/17

Report navigator47/47

Environmentok

UI smoke725 ok

入口 smoke72/72 ok

健檢338 ok

Launchd report可執行

本地節點91%

人工待辦4 項

現在建議動作

ok / view

等待週四 06:00 自動跑

只需要打開查看打開 automation-schedule.html

2026年8月20日星期四上午06:00 [GMT+8]；0 天 11 小時 0 分

automation-schedule.html

ok / double-click

看最近一次自動化收據

建議用 Finder 雙擊雙擊 open-receipt.command

確認最近一次 local pipeline、verify、產出檔、連結檢查與最慢步驟。

open "../open-receipt.command"

open-receipt.command

manual / manual

10:00 後處理人工待辦

需人工處理打開 manual-actions.html 逐項處理

2 個人工項目；通常是 GPT Pro handoff、OpenWiki review、RAG clinical review。

manual-actions.html

開啟完整 Next Actions存在｜automation-next.html 開啟 State Snapshot存在｜automation-state.html

主要操作

可用

0. START HERE

不知道該按哪個時，雙擊這個。它會刷新視覺頁，打開控制台與 Operator Pick；只有你在 Terminal 按 r 才會啟動推薦入口。

START-HERE.command

open "./START-HERE.command"

"./START-HERE.command" --no-open --skip-sync

可用

0a. 雙擊打開控制台

日常入口。只會用瀏覽器打開這個頁面，不會啟動外部 API。

open-control-center.command

open "./open-control-center.command"

可用

0b. 打開執行操作台

把所有雙擊入口整理成按鈕牆，分清楚只看、檢查、執行與修復。

open-cockpit.command automation-cockpit.html

open "./open-cockpit.command"

可用

0c. 打開執行中監控

每 2 秒重生 live monitor HTML，頁面每 3 秒刷新，適合流程正在跑時放旁邊看。

open-live-monitor.command automation-live.html

open "./open-live-monitor.command"

可用

0d. 雙擊 10:00 閱讀

刷新 Daily Brief / State / 控制台，直接打開閱讀頁、workflow 和 OpenWiki。

open-daily-brief.command

open "./open-daily-brief.command"

可用

0d. 目前 run bundle

直接打開本輪 run folder、status.json、mega.md、workflow、GPT handoff、manual-actions、report 與 RAG queue。

open-current-run.command current run folder

open "./open-current-run.command"

可用

0d. 最近一次收據

先打開最近一次自動化收據；雙擊 open-receipt.command 後會刷新並確認 local pipeline、verify、outputs、launchd 與 UI smoke 是否全綠。

open-receipt.command automation-receipt.html

open "./open-receipt.command"

ready-with-manual

0d. 一句話決策

本地自動化 ready；2 個人工項目留作品質補完，不阻塞 10:00 閱讀。

open-decision.command automation-decision.html

open "./open-decision.command"

可用

0e. 健康報告

直接確認 launchd、local-only 邊界、雙擊入口 smoke 與 schema gate 是否全綠。

open-health.command automation-health.html

open "./open-health.command"

可用

0f. 同步視覺報表

畫面看起來舊、Freshness 有 stale、或各 dashboard 數字不同步時使用。只刷新視覺報表與控制台，不重跑 paper pipeline。

sync-visuals.command automation-visual-sync.html

open "./sync-visuals.command"

可用

1. 雙擊執行完整流程

Finder 打開專案資料夾，雙擊這個檔案。它會跑完整 local-only pipeline、驗收檢查、更新視覺頁，完成後自動回到控制台。

run-automation.command

npm --prefix "." run automation:run-and-verify

可用

1b. 雙擊快速健檢

不重新跑 paper pipeline，只驗證目前輸出、視覺頁、連結、下一步與操作入口。

check-automation.command

npm --prefix "." run automation:check -- runs/2026-07-15/single-one-stage-versus-two-stage-exchange-arthroplasty-for-periprosthe/status.json

可用

1c. 雙擊排錯儀表板

不重跑 paper pipeline；刷新並打開 State、Local Pipeline、Run + Verify、Quick Check、Launchd。

open-debug-dashboard.command

open "./open-debug-dashboard.command"

可用

1d. 最近失敗 log

打開最近 failed step 的 stdout/stderr、timeline 與 health；目前全綠時會告訴你沒有新的失敗。

open-latest-failure.command automation-timeline.html

open "./open-latest-failure.command"

已建立

2. 看自動化地圖

像 n8n 的視覺節點圖，能看每一步 command、輸入、輸出、狀態。

automation-map.html

npm --prefix "." run automation:map -- runs/2026-07-15/single-one-stage-versus-two-stage-exchange-arthroplasty-for-periprosthe/status.json

可雙擊

3. 安裝週四排程

不用手打 cp / launchctl；Finder 雙擊後會安裝、健檢並打開控制台。若用終端機，請複製下方完整指令，避免在家目錄找不到 launchd/。

install-launchd.command

npm --prefix "." run launchd:install

可雙擊

3b. 安裝並試跑

第一次設定最推薦：安裝 LaunchAgent、立刻觸發、輪詢到結束，並產生驗收報告。這才是完整排程驗收。

install-and-test-launchd.command automation-launchd-test.html

open "./install-and-test-launchd.command"

可雙擊

4. 立即觸發排程

只送出 launchd 觸發，不等待完整流程結束；適合手動啟動一次。要驗收跑完請用 3b。

kickstart-launchd.command

npm --prefix "." run launchd:kickstart

需人工

5. 處理人工待辦

GPT Pro handoff、wiki 複核、RAG ready 等不能自動做的事集中在這裡。

manual-actions.html

npm --prefix "." run manual:actions -- runs/2026-07-15/single-one-stage-versus-two-stage-exchange-arthroplasty-for-periprosthe/status.json

雙擊失敗時看這裡

四個主要 .command 已經會在失敗時停住 Terminal，並印出診斷頁與安全指令。這裡是人工排錯捷徑。

完整流程失敗 入口：run-automation.command automation-run-and-verify.html automation-health.html

npm --prefix "." run automation:run-and-verify

快速健檢失敗 入口：check-automation.command automation-check.html automation-next.html

npm --prefix "." run automation:check -- runs/2026-07-15/single-one-stage-versus-two-stage-exchange-arthroplasty-for-periprosthe/status.json

安裝排程失敗 入口：install-launchd.command automation-launchd-diagnose.html automation-health.html

npm --prefix "." run launchd:install

立即觸發失敗 入口：kickstart-launchd.command automation-launchd.html automation-launchd-diagnose.html

npm --prefix "." run launchd:kickstart

launchd 快修卡

看到 cp: launchd/... No such file or directory、Bootstrap failed、Could not find service 時，不要從 home 目錄手動複製 plist；改用這張卡。

排程已驗收

launchd 可以接手週四 06:00 自動化。

LaunchAgent 已載入、plist 同步，最近一次 launchd:test 也以 exit 0 結束。

Serviceloaded / plist synced / 待命中

最近 launchd 試跑runs 1 / exit 0 / ok

排程Weekday 5, 06:00

repair-launchd.command install-and-test-launchd.command diagnose report test report

Terminal 安全貼上順序

先修復，再完整試跑；只想看狀態時用 status。使用 npm --prefix，所以人在任何 Terminal 目錄都可貼。

open-safe-terminal.command automation-safe-terminal.html

npm --prefix "." run launchd:repair

npm --prefix "." run launchd:test

npm --prefix "." run launchd:status

不要貼這種

這是錯誤反例，不是可複製指令。人在 ~ 會找不到 launchd/，而且手動 bootstrap 不會自動修正 Node 路徑；請改貼上方 npm 指令。

cp launchd/... ~/Library/LaunchAgents/ launchctl bootstrap gui/$(id -u) ~/Library/LaunchAgents/...

診斷但不修改

不想動 LaunchAgent，只想知道現在壞在哪裡，就跑診斷。

npm --prefix "." run launchd:diagnose

automation-launchd-diagnose.json automation-launchd.json

可執行性狀態

本地流程完成率

10 / 11 個 local nodes ready。最新 automation: 2026-08-14T12:34:49.483Z。

Automation manifest

source of truth readyreports: 47 / commands: 24 / scripts: 95

check 通過ok: 261 / warning: 0 / error: 0

Safety gates 守住external: 6 / 0 errors；orchestrator: 6 / 0 errors。

readylocal-only manifest for pages, command files and npm scripts。

automation-manifest.html automation-manifest-check.html automation-executability.html

macOS launchd

排程可用service: loaded / plist: synced / checks: 7/7

待命中state: not running / runs: 1 / last exit: 0

Weekday 5, 06:00每週四 06:00 自動觸發本地流程；not running 代表待命，不是失敗。

stderr 空白source: automation-launchd.json / stdout 3605 bytes

npm --prefix "." run launchd:kickstart

automation-launchd.html automation-launchd-diagnose.html

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本次論文

Title	Subspecialty	Study type	Wiki	GPT	RAG
One-Stage Versus Two-Stage Exchange Arthroplasty for Periprosthetic Joint Infection The Journal of Bone and Joint Surgery / 2026-07-15	Infection	RCT	needs_review	manual	queued

Manual queue 摘要

優先順序

high：1

medium：2

low：1

下一步

打開 automation-map.html 看本地自動化狀態；若 GPT Handoff 是需人工，開啟 gpt-pro-handoff.md 貼到 GPT Pro，再回填 clinical guide。

開啟 manual-actions.html處理 GPT Pro / Wiki / RAG 人工項目 開啟 readiness report判斷週四 06:00 是否可放心自動跑 開啟 health report查看 41 項可執行性檢查 開啟 operator runbook照情境處理失敗或人工缺口

Started	Status	Duration	Log
2026-08-14T12:34:09.777Z	成功	39.7 s	automation-log
2026-08-14T11:50:36.740Z	成功	19.3 s	automation-log
2026-08-14T08:32:39.104Z	成功	16.5 s	automation-log
2026-08-14T08:23:29.796Z	成功	22.7 s	automation-log
2026-08-14T07:48:45.060Z	成功	16.1 s	automation-log

現在建議動作

等待週四 06:00 自動跑

看最近一次自動化收據

10:00 後處理人工待辦

主要操作

0. START HERE

0a. 雙擊打開控制台

0b. 打開執行操作台

0c. 打開執行中監控

0d. 雙擊 10:00 閱讀

0d. 目前 run bundle

0d. 最近一次收據

0d. 一句話決策

0e. 健康報告

0f. 同步視覺報表

1. 雙擊執行完整流程

1b. 雙擊快速健檢

1c. 雙擊排錯儀表板

1d. 最近失敗 log

2. 看自動化地圖

3. 安裝週四排程

3b. 安裝並試跑

4. 立即觸發排程

5. 處理人工待辦

雙擊失敗時看這裡

launchd 快修卡

launchd 可以接手週四 06:00 自動化。

Terminal 安全貼上順序

不要貼這種

診斷但不修改

可執行性狀態

本地流程完成率

Automation manifest

macOS launchd

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本次論文

Manual queue 摘要

優先順序

下一步

最近執行紀錄